淋病治疗不当会引起很多的并发症，常见的并发症有列腺炎发、精囊炎、附睾炎、淋病合并尿道狭窄等，而女性的病发症有淋菌性盆腔炎、急性输卵管炎、子宫内膜炎、盆腔脓肿、腹膜炎等疾病。如果病情一直不能得到有效的抑制就有可能引起严重的后果甚至危及生命。

(1)对上皮的亲和力：

淋球菌对柱状上皮和移行上皮有特别的亲和力，男女性尿道，女性宫颈覆盖柱状上皮和移行上皮，故易受淋球菌侵袭，而男性舟状窝和女性阴道为复层扁平上皮覆盖，对其抵抗力较强，一般不受侵犯，或炎症很轻，故成年妇女淋菌性阴道炎少见，幼女由于阴道黏膜为柱状上皮，因此易于受染，皮肤不易被淋球菌感染，罕见有原发性淋球菌皮肤感染，人类对淋球菌无先天免疫性，痊愈后可发生再感染。

(2)黏附：

淋球菌菌毛上的特异性受体可与黏膜细胞相应部位结合;其外膜蛋白Ⅱ可介导黏附过程;它还可释放IgAl分解酶，抗拒细胞的排斥作用，这样，淋球菌与上皮细胞迅速黏和，微环境中的酸碱度，离子桥，疏水结构和性激素等也可促进黏附过程。

(3)侵入与感染：

淋球菌吸附于上皮细胞的微绒毛，其外膜蛋白I转移至细胞膜内，然后淋球菌被细胞吞噬而进入细胞内，淋球菌菌毛可吸附于精子上，可迅速上行到宫颈管，宫颈管的黏液可暂时阻止淋球菌至宫腔，而在宫颈的柱状上皮细胞内繁殖致病，淋球菌一旦侵入细胞，就开始增殖，并损伤上皮细胞，细胞溶解后释放淋球菌至黏膜下间隙，引起黏膜下层的感染。

(4)病变形成：

淋球菌侵人黏膜下层后继续增殖，约在36h内繁殖一代，通过其内毒素脂多糖，补体和IgM等协同作用，形成炎症反应，使黏膜红肿，同时，由于白细胞的聚集和死亡，上皮细胞的坏死与脱落，出现了脓液，腺体和隐窝开口处病变最为严重。

(5)蔓延播散：

淋球菌感染后造成的炎症可沿泌尿，生殖道蔓延播散，在男性可扩展至前列腺，精囊腺，输精管和附睾，在女性可蔓延到子宫，输卵管和盆腔，严重时淋球菌可进入血液向全身各个组织器官播散，导致播散性感染。