非淋菌性尿道炎主要由沙眼衣原体和解尿支原体引起，其他病原体如阴道滴虫、白色念珠菌、阴道嗜血杆菌等，所占比例较小。综合其病因多是因为不洁的性交关系引起的。这是感染非淋的主要原因。非淋菌性尿道炎一般传播比较快，感染率比较高。

1、致病菌耐药。由于发病初期治疗不规范，盲目用药、破坏内环境，并造成细菌耐药，疗效不佳，时好时坏，导致持续的非淋菌性尿道炎发生。这也是一种比较常见的致病因素，因此在选择的时候一定要选择正规的医院进行治疗。

2、潜伏隐匿感染。部分微生物引起的非淋菌性尿道炎经抗生素治疗后，因药效和疗法的缺陷细菌将进入潜伏感染

状态，在饮酒、劳累、精神紧张等因素可能诱使潜伏致病菌繁殖，从而出现症状，即非淋菌性尿道炎复发。由此可见保持平稳的心态的重要性，我们需要有更加深入的了解。

3、隐深部位的感染。由于致病菌隐藏于组织深层，以及潜藏于尿道隐窝，尿道旁腺等部位，使得药物很难对其全面杀死，给康复留下了后患。同时急性非淋菌性尿道炎有可能伴发前列腺炎，当非淋菌性尿道炎治疗后，仍可因来自前列腺的感染而复发。一定要及时的进行治疗，才能更好的保护自己的健康。

4、并发症的影响。如若病情反复，长期炎性损害，造成尿路黏膜、肾盂肾盏受损、纤维化、变形，尿路梗阻、畸形影响了正常的尿液引流和治疗，都给非淋菌性尿道炎的治疗带来影响。因此，一但发现非淋菌性尿道炎原因及时的进行治疗是非常有必要的，我们一定要多加注意。

5、免疫力低下。有些患者免疫力低下，如合并有糖尿病、肿瘤、肝病、营养不良或其他慢性疾病，对尿道炎的治疗也造成很多困难。提高免疫力的最佳方法就是应当要适当的增加锻炼的机会，这是最基本的提高我们身体免疫力的方法。