原发性生殖器疱疹感染潜伏期约为3～5天，患部先有烧灼感，出现红斑，很快在红斑的表面发生3～10个成簇分布的小水疱，数日后成为小脓疱，破溃后形成糜烂面和浅溃疡，局部红肿，有烧灼样疼痛。女性病人多发生于阴唇、肛门周围、阴道，但约90%的病人可同时侵犯子宫颈引起子颈炎或子宫炎;男性病人多发生于龟头、冠状沟、尿道口或阴茎体，有时可并发尿道炎。大多数患者有双侧腹股沟淋巴结肿大。

生殖器疱疹病毒的传染源是患者及亚临床无症状的带病毒者，尤其是在患者的生殖器皮肤或粘膜的疱疹内含有单纯疱疹病毒，可通过性接触而传染给配偶或其他性侣，也可在同性恋者中互相传染。有时在口腔或口腔周围患有疱疹的人，可通过口腔-生殖器性生活，使对方传染生殖器疱疹。因此，不同方式的性行为，也可传播生殖器疱疹病。

由于有感染性的病毒能在潮湿的环境中存活数小时，因而单纯疱疹也可通过污染物而间接传播。生殖器疱疹是一种普遍的性疾病，因为生殖器疱疹在潜伏其中也有传染性，所以会让人在不知不觉得情形下成为疱疹的的传播者和受害者。

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