梅毒的诊断应十分认真仔细、因为它和许多其它疾病的表现有相似之处，表现多样，复杂且病程很长，有很长的时间处于潜伏状态，诊断时必须结合病史，体格检查及化验结果，进行综合分析判断，必要时还需进行追踪随访，家庭调查和试验治疗等辅助方法。
一、病史：
（一）不洁性交史：应尽量询问患者的嫖娼史或其他不洁性交史以确定传染源。如肛门有硬下疳，应询问是否有肛交史。问清楚不洁性交的时间，对于确定梅毒的潜伏期是十分必要的。
（二）现病史：有无阴部溃烂、皮肤红斑、丘疹、湿疣史，有否发生过硬下疳、二、三期梅毒史。梅毒血清学试验检测情况。
（三）婚姻史：有无涉外婚姻，结婚次数，配偶有无性病或可疑性病的临床表现等。
（四）分娩史：有无先兆流产、早产、流产和死产的病史，过去有无分娩胎传梅毒儿史。
（五）如有可疑先天性梅毒，应询问父母是否患过梅毒，及兄弟姐妹受染情况及本人有无早期和晚期梅毒的症状和体征。
（六）如怀疑潜伏梅毒，询问传染史以及有无存在致使血清试验生物学假阳性的疾病。
（七）治疗史：是否做过驱梅治疗，用药剂量及疗程，是否正规，有无药物过敏史等。
二、体格检查
（一）一般检查：生长发育状况是否良好，精神状态情况；
（二）皮肤粘膜：根据早期和晚期梅毒的皮肤损害特点仔细检查全身皮肤、粘膜、淋巴结、毛发、生殖器官、肛门、口腔等。
（三）特殊检查：眼、骨骼系统、心脏及神经系统的深入检查或进行专科检查。
三、实验室检查：
（一）早期梅毒应做梅毒螺旋体暗视野显微镜检查。
（二）梅毒血清反应素试验（如vdrl、usr或rpr试验），有必要时再做螺旋体
抗原试验（如fta-abs或tpha试验）。
（三）脑脊液检查，以除外神经梅毒，尤其无症状神经梅毒，早期梅毒即可有神经损害，二期梅毒有35%的病人脑脊液异常，因此要检查脑脊液。
（四）基因诊断检测。