先天性梅毒依据其临床症状出现时间的早晚可分为早期先天性梅毒和晚期先天性梅毒，出生后2年内出现临床症状的称为早期先天性梅毒，2年后出现临床症状的称晚期先天性梅毒。

胎儿期表现先天性梅毒在胎儿期可表现为肝脏肿大，胎盘增厚，胎儿水肿，宫内生长迟缓，非免疫性溶血，早产，死胎等。在某些非洲国家梅毒螺旋体感染的死胎高达5%～42%;在马拉威26%的死胎、11%的新生儿死亡、8%的婴儿死亡归因于梅毒螺旋体感染。

出生后表现先天性梅毒患儿出生时66%无临床症状，多在出生后4～8周出现症状。早期先天性梅毒表现为肝脾肿大、皮疹(脓疱疹、脱皮、斑丘疹)、黄疸、慢性鼻炎、脑膜炎、肠梗阻或出血、间质性肺炎、肺脓肿、白内障、脑积水等，晚期先天性梅毒表现为间质性角膜炎、马鞍鼻、hutchion牙、军刀状胫(胫骨前凸)、耳聋、智力发育迟缓，甚至死亡等。