全球范围来看，多数感染者是通过性交而感染的。在艾滋病病毒肆虐的国家里，男女感染的人数大致相等，然而，妇女通常是在年纪较轻的时候感染上的，这是因为如下一些原因所致：年龄较大的男人一般选择年纪较轻的女性做为性伙伴；年轻女性的社会经济地位的低下，在两性关系上处于被动地位；年轻女性的生理结构决定其更容易受到感染，因为阴道壁很薄，在性交过程中由于磨擦，容易产生微小破损，这也反应在许多国家日渐增加的强奸女童的现象上。
病毒通过性交传播时，带有病毒的精液或阴道分泌物，穿过粘膜而进入性伴侣的阴道壁、阴茎、肛门或口腔里的血管，而且艾滋病毒很容易透过阴茎的皮肤伤口而传染给性伴侣。
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