生殖器疱疹与生殖器恶性肿瘤关系密切。早在60年代就有人提出引起生殖器疱疹的Ⅱ型疱疹病毒可能是宫颈癌的潜在致癌因子。近十多年来，已发现宫颈癌和性活跃肿关，而Ⅱ型疱疹病毒又是性活跃人群中常见的致病因子，宫颈又常是病毒的复制部位；并且发现生殖器疱疹常与宫颈癌并发。患过生殖器疱疹的妇女比未患过者得宫颈癌的危险性大5-10倍。最近，在宫颈癌组织、剥落细胞或癌前期细胞中发现了Ⅱ型疱疹病毒特异性抗原。从而表明了Ⅱ型疱疹病毒在宫颈癌的发生过程中起了重要作用。
另外，从阴茎癌病人活检材料中也观察到单纯疱疹病毒样颗粒。然而表明单纯疱疹病毒是生殖器恶性肿瘤致癌因子的直接证据仍不足，尚有待于进一步证实。
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