衣原体为革兰氏阴性病原体，是一种专性细胞内微生物，没有合成高能化合物ATP、GTP的能力，必须由宿主细胞提供，因而成为能量寄生物。衣原体是一类能通过细胞滤器，有独特发育周期、严格细胞内寄生的原核细胞型微生物。 衣原体具有以下特点： (1)具有DNA和RNA两种类型的核酸;并以二等增殖法进行繁殖，发育周期特别。这与病毒不同。 (2)细胞壁成份中含有肽聚糖;衣原体内含有核蛋白体。 (3)与立克次体不同，除了不能合成高能化合物外，还在于没有细胞色素，没有呼吸性电子链的其他组分以及独特的发育周期。 (4)对多种抗生素都敏感。 衣原体的生长发育周期分两个阶段：原生小体(elementary body)，是发育周期的感染阶段，具感染力;网状小体(initial body)，是在感染细胞内的繁殖阶段，具增殖力。在电镜下可见胞膜呈有丝分裂繁殖。 原生小体先附着于易感细胞的表面，然后通过细胞的吞噬作用进入细胞内，形成网状小体在细胞内繁殖，以后形成包涵体，同时对组织产生炎症变化而引起一系列的临床症状。衣原体的全部生长发育约48小时(有的72小时)，完成生长周期后，网状小体重新组织，在一对一的基础上缩合成原生小体，后者从空泡中释放再感染其他细胞。在整个约48小时的生长发育周期中，衣原体始终处于一个吞噬体中，直到细胞严重损伤和细胞死亡。原生小体在电镜下呈球形，直径200-300毫微米，DNA紧密连接并呈锥状电子密度。分子量6-11*105，明显小于细菌和立克次体，相当于支原体，是大的痘病毒的3-5倍。网状小体呈圆形或椭圆形。 衣原体是自然界中传播很广泛的病原体。衣原体广泛寄生于人类，哺乳动物及鸟类，仅少数有致病性。 衣原体属有两个种可以引起人类疾病： 沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)和鹦鹉热衣原体。后者引起禽类疾病，偶尔波及到人;前者引起人类疾病。两者具有共同的组抗原――脂多糖复合物。两者的区别是沙眼衣原体的包涵体中含有糖元，碘染色可以着色，并对磺胺敏感;而鹦鹉热衣原体的包涵体中不含有糖元，对磺胺不敏感。 通过微量免疫荧光法，沙眼衣原体又分为15个血清型。其中，A、B、Ba、C血清型是沙眼的病原体，主要引起眼疾患;L1、L2、L3血清型是性病性淋巴肉芽肿(第四性病)的病原体;D、E、F、G、H、I、J、K8血清型引起生殖系统感染和散发的结膜炎。除L1、L2、L3以外，其余毒力较低，易感染结膜组织，特别是柱状上皮细胞。 衣原体对热敏感，56℃-60℃仅能存活5-10分钟，在-70℃可保存数年。0.1%甲醛液、0.5%石碳酸可将衣原体在短期内杀死，75%乙醇杀灭力很强，半分钟即有效，对利福平、四环素、红霉素均敏感。