常常见有一些患者，经过各种各样的西药治疗，但是症状常不能消退，病情不能得到有效的控制。他们都十分焦虑，希望能得到中医的治疗。据gopla的临床经验，中医治疗确实是一种有效的方法。中医治疗本病，消除症状快，治愈彻底。这是由于中医治病常用复方中药治疗，由于是多种药物的联合，不容易产生耐药性，而且中医的辨证施治，可以因人施药，改变人体的内环境。
中医认为本病是由于不洁性交，或洗涤用具不洁，或摄生不慎，湿热毒邪侵犯下焦，伤及泌尿生殖系统，继而出现气血瘀阻、脾肾亏损等证候，所以临床上，本病常被分为下焦湿热、气血瘀阻及脾肾亏损三型治疗。

下焦湿热型非淋菌性尿道炎症状见小便频数短涩，或尿道有黄白色秽浊之物流出，女性有阴部瘙痒、带下量多、小腹疼痛，患者多伴有口苦口粘，脘腹胀满等症状，舌红苔黄腻，脉弦滑。这是由于湿热毒邪侵犯下焦，膀胱气化不利，不能分清泌浊所致。治疗宜清热利湿，解毒化浊。常用方药如下：石菖蒲20g　车前子10g　黄柏10g　白术10g　丹参30g　莲子心10g　败酱草30g　忍冬藤30g　土茯苓30g　生甘草10g。如疼痛明显者，可加入白花蛇舌草30g，马鞭草30g；如分泌物多时，可加入木通10g，泽泻1.0g。本方既有清热除湿的车前子、莲子心，又有解毒化浊的石菖蒲、黄柏、败酱草、忍冬藤、土茯苓、生甘草等。

气血瘀阻型非淋菌性尿道炎症状常见有小便淋漓不畅，或尿道口有秽浊之物流出，或带下异常，小腹胀痛，舌暗，苔白，脉弦细。这是由于久病入络，或由于湿热之邪阻滞经脉，气血瘀阻所致。治疗宜行气活血，化浊止痛。常用药物为膈下逐瘀汤加减：当归10g　川芎10g　赤芍10g　桃仁10g　枳实10g　元胡10g　五灵脂10g　乌药10g　香附10g　牛膝10g　土茯苓30g　滑石20g　生甘草10g。如尿痛明显者，可加入白花蛇舌草30g，淡竹叶10g。本方当归、川芎、赤芍、桃仁、五灵脂均具有活血化瘀的作用，枳实、元胡、乌药、香附理气行滞，土茯苓、滑石、生甘草解毒利湿。

脾肾亏虚型非淋菌性尿道炎症状为小便淋漓不尽，遇劳即发，或尿道口有白浊之物，女性白带量多，腰膝酸软，大便溏薄，舌质淡，脉软。这是由于久病失治误治，伤及脾肾。治疗宜健脾补肾，利湿化浊。常用方药为四君子汤合六味地黄丸加减：党参10g　黄芪30g　白术10g　茯苓30g　山药30g　山茱萸10g　熟地10g　泽泻10g　丹皮10 g　牛膝10g　忍冬藤30g。本方党参、黄芪、白术、茯苓、山药均有健脾利湿的作用；山茱萸、熟地补肾；泽泻、丹皮、牛膝、忍冬藤利湿、活血、解毒。