在现在的医疗环境下，临床上生殖器疱疹的治疗，目前尚无理想的方法。由于该病有自限性，1-2周可自愈。大多数男性患者预后良好。因此，治疗的目就是尽量缩短病程，减轻痛苦，防止继发感染和并发症，减少复发次数。

临床上治疗生殖器疱疹的一般治疗如下：(1)局部要保持疱壁完整、清洁及干燥，尽量避免继发细胞感染，每天用等渗盐水(0.9%生理盐水)清洗2~3次，并吸干，不要让疱顶脱落，并可外涂2%龙胆紫溶液、30%~50%氧化锌油、0.5%新霉素软膏、0.3%环丙沙星软膏和3%~5%无环鸟苷软膏(或霜剂)，亦可用0.1~0.25%疱疹净软膏。面积较大者可用0.1%硫酸锌溶液或10%醋酸铝湿敷。(2)如果局部皮损出现继发感染时，可选用敏感的抗生素。(3)对局部疼痛剧烈者，给予精神安慰，可应用阿司匹林或吲哚辛等止痛剂。如果效果欠佳，可用局部麻醉剂如5%盐酸利因软膏等。

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